【下载】tripos sybyl 7.2
搞药物化学的没有人不知道 [color=deeppink][size=3][glow=255,red,2]sybyl[/glow][/size][/color]吧？这个软件挂在网上一个多月了，鸭绿江还不知道。下载地址：
emule:
[url]http://lib.verycd.com/2006/07/14/0000110695.html[/url]
[color=blue]共5.0GB，下载速度取决于同时下载人数的多少。我花了十多天时间才搞定。
这个程序必须在基于UNIX的操作系统上才能运行，推荐使用国产的红旗LINUX或OpenDesktop。在windows系统中，可以通过虚拟机安装LINUX系统而运行sybyl。[/color]
尚未见到有关sybyl的使用教程，这个本人亦十分期待。
软件介绍：（参见e维:[url]http://9iv.com/down/soft/3135.htm[/url]）
[color=indigo]Tripos Sybyl 7.2 (分子模拟):[/color]
SYBYL软件包，Tripos出品的专业分子模拟平台，涵盖了分子模拟与显示、定量构效关系和ADME、药效团模型、生物信息学、基于结构的药物设计、化学信息学和数据库、组合化学和分子多样性、NMR数据处理、化合物实体提供等多种与药物研究和开发相关的方向，为用户提供全面的药物设计和生物化学研究的解决方案。
Sybyl是Tripos公司专门为药物小分子与生物大分子科学领域研究者所设计分子模拟软件。
模拟的内容包括了药物小分子的建模、构象分析、三维定量构效关系研究、药效团建模、虚拟筛选、生物大分子的同源模建、活性位点分析、数据库搜索等。
包括以下内容相关的模块:
基本操作平台(包括开发平台) Linux 操作系统下运行
基于配体的药物设计(药效团概念、QSAR和ADME)
药物设计(虚拟筛选 和de novo设计)
组合化学(化学库设计和分子多样性)
结构生物学(大分子模拟和同源模建)
信息学(生物信息学和化学信息学)
NMR相关模块
具体的模块包括：建模用模块Sybyl/Base，构象分析模块Advanced Computation、分子动力学模块Dynamics，表面性质计算和显示模块MOLCAD,三维定量构效关系模块QSAR with CoMFA，药效团分析模块DISCOtech，虚拟筛选模块FlexX, CScore, ADME性质预测模块Volsurf, 生物大分子建模Biopolymer，同源模建模块Composer, FUGUE, 活性位点分析模块SiteID，数据库检索模块Unity等 [quote][b]引用第0楼[i]oringyoung[/i]于[i]2006-08-22 09:40[/i]发表的“[转贴]【下载】tripos sybyl 7.2”[/b]:
共5.0GB，这个程序必须在基于UNIX的操作系统上才能运行，推荐使用国产的红旗LINUX或OpenDesktop。在windows系统中，可以通过虚拟机安装LINUX系统而运行sybyl [color=deeppink][size=3][glow=255,red,2]sybyl[/glow][/size][/color]吧？这个软件挂在网上一个多月了，鸭绿江还不知道。
下载地址：
emule:
[url]http://lib.verycd.com/2006/07/14/0000110695.html[/url]
.......[/quote]
请问在windows系统中，怎样通过虚拟机安装linux系统来运行sybyl
能否详细说一下
最好step by step
谢谢！！！ 推荐试用，不推荐使用在文章中，发表后给自己和导师带来很多麻烦 step by step太费事，我就简要说说：
后来发现红旗LINUX或OpenDesktop均不太稳定，有时不能运行或不能安装，据介绍以Red Hat 9.0 WS版以上为好。
我用的虚拟机为 VPC虚拟机5.2精简版 （注意这个程序最好在win xp下使用，98下可能出现找不到文件的结果）；虚拟光驱软件为Daemon 3.47。
1 先将Red Hat 9.0的iso文件装入虚拟光驱，
2 运行 VPC虚拟机5.2精简版 ；
3 新建立PC，根据提示操作；
4 在VPC虚拟机5.2中载入Red Hat 9.0的虚拟光驱；
5 在VPC虚拟机5.2点重新启动（只会启动虚拟机，不会重启windows），即可出现Red Hat 9.0安装画面；
6 安装Red Hat 9.0后，重启虚拟机，注意将Red Hat 9.0的iso文件退出虚拟光驱；
7 将sybyl 7.2的第一个iso文件载入虚拟光盘；并将此虚拟光盘载入虚拟机；
8 在Red Hat 9.0虚拟机中，打开光盘，运行其中的install.sh，即可出现sybyl的安装画面，根据提示即可进行安装。
注意事项：
1 sybyl、Red Hat的文件均很大，请准备足够大的硬盘；
2 在虚拟机中运行的速度取决于内存大小，PC的内存以256MB以上为好，推荐使用512MB；
3 请先学习Red Hat的安装。
[quote][b]引用第1楼[i]tugg188[/i]于[i]2006-09-16 16:34[/i]发表的“”[/b]:
请问在windows系统中，怎样通过虚拟机安装linux系统来运行sybyl
能否详细说一下
最好step by step
谢谢！！！[/quote] LINUX WS 3 完全可以用。 请加我, [quote][b]引用第3楼[i]oringyoung[/i]于[i]2006-09-25 21:09[/i]发表的“”[/b]:
step by step太费事，我就简要说说：
后来发现红旗LINUX或OpenDesktop均不太稳定，有时不能运行或不能安装，据介绍以Red Hat 9.0 WS版以上为好。
我用的虚拟机为 VPC虚拟机5.2精简版 （注意这个程序最好在win xp下使用，98下可能出现找不到文件的结果）；虚拟光驱软件为Daemon 3.47。
.......[/quote]
老兄，我按你的方法装好了虚拟机和linux系统,但在装sybyl时运行 install.sh安装时，
电脑没反应，不能安装
请问你是怎样安装sybyl的
请祥细说明
最好step by step，贴个图
谢谢！！！！ 我在LINUX 下安装了,可是动行不能成功呀,
几天了还是弄不好,
请各位指点一下好吗,?
万分感谢!
QQ : 276751994 sybyl 不是要 注册码 （license file）的吗？ 怎样运行安装的，请安装过的兄弟指点一下，谢谢，本人不知道怎样安装，双击install.sh肯定是不行的，该如何安装呢？ 在shell中输入 >sh ./install.sh 就可以运行安装文件了，可以不必虚拟光驱，只要将每张盘的文件分别放在一个文件夹中就行，linux下光驱就是一个文件夹。 有没有在suse下用过的朋友啊，我得师suse 9.3的，不知道行不行？？ 可是我在这里下载的sybyl 7.2，在安装的时候提示我缺一个license.dat文件 。请问怎么办呢 有详细的安装说明吗?谢谢各位 [quote]引用第3楼oringyoung于2006-09-25 21:09发表的 :
注意事项：
1 sybyl、Red Hat的文件均很大，请准备足够大的硬盘；
2 在虚拟机中运行的速度取决于内存大小，PC的内存以256MB以上为好，推荐使用512MB；
3 请先学习Red Hat的安装。
.......[/quote]
PC的内存512MB还是太小，特别是用atuodock进行对接时，如果用DOCK虚拟筛选数据库和化合物库时，根本是不够用的；现在内存便宜，建议至少2KMB。
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