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syhu007012 发表于 2007-4-3 22:19

【下载】《InsightII 生物分子模拟软件》(ACCELRYS INSIGHT II 2005 LINUX READ

  [url]http://lib.verycd.com/2007/03/31/0000145223.html[/url]

InsightII

  Accelrys公司的InsightII三维图形环境软件包,集成了从生物分子结构功能研究到基于靶点药物设计的全套工具,是生物学家从事理论研究和具体实验方案设计的助手。InsightII针对生命科学应用,提供生物分子及有机小分子建模和显示工具,功能分析工具,结构改造工具,动力学模拟工具等,帮助研究人员在实验前全面了解生物分子的结构与功能,从而有针对性的设计实验方案,提高实验效率,降低科研成本。InsightII在揭示蛋白质结构功能关系、生物分子结构模拟与动力学计算、基于靶点药物设计、抗体设计、酶工程、生物分子间的相互作用(包括蛋白质与蛋白质、蛋白质与肽、蛋白质与核酸、蛋白质与有机小分子)、生物分子核磁共振、功能基因组以及蛋白质组等方面有着广泛的应用。InsightII应用的生命科学研究领域包括:

●酶学
●免疫学
●生物信息学
●生物物理学
●结构生物学
●新药开发
●病毒学
●遗传与发育生物学
●肿瘤研究

  InsightII 软件能够运行在SGI IRIX、Red Hat Linux和IBM AIX系统上,是Accelrys生命科学产品线中的主要平台之一。InsightII有十多年的开发历史,图形界面友好、便于使用,集成了从生物分子结构功能研究到基于靶点的药物设计的全套工具。

  1) 核心模块及图形界面
  2) 结构模型构建工具
  3) 能量计算工具
  4) 生物大分子结构模建与性质分析
  5) 基于靶标结构的药物设计
  6) 核磁共振结构测定

 ·核心模块及图形界面

  InsightII LS:作为整个InsightII软件的图形界面,它将各种应用程序集成在一个便于使用的环境中,并集成了一些共性的分子操作工具。界面方便、简单、友好,初学者能够运用自如。

 ·结构模型构建工具

  Sketcher:帮助用户构建分子结构,从大量复杂的数据中得到重要的结论。用户可以用Sketcher画出分子的二维结构,仅仅需要定义元素类型、连接键的形式和立体选择性,模块能够将分子的二维绘图自动转化为三维构象。

 ·能量计算工具

  Discover:分子力学计算的工具。进行分子力学及分子动力学模拟、优化和构象搜索,预测有机物、无机物、有机金属和生物系统等分子系统的结构、能量及特性,帮助用户验证工作中的假设,指导实验进行的方向。包括著名的Amber力场、cvff力场、esff力场和cff91力场,InsightII 中强有力的三维图形功能可以将结果显示出来,便于用户清晰快速地理解所研究的系统。Discover中集合的工具对于结构和动力学轨迹分析都很有用。

  CHARMm:由哈佛大学开发的分子力学计算工具。可以为用户提供处理各种小分子、大分子(包括蛋白质、核酸和糖)的经验化能量计算,模拟过程提供了有关分子结构、相互作用、能量等信息。CHARMm程序能够与InsightII软件包中的其他程序相互合作,完成各种模拟计算,为用户的理论分析提供补充。

  CFF:具有量子力学尺度的第二类力场。CFF力场中的参数是通过对近2000个不同分子的超过200万次基于量子力学的能量及能量导数的计算而得。覆盖包括蛋白质、核酸、糖、脂类等生物大分子及有机小分子,特别适用于对复合物体系(如蛋白质/DNA、酶/底物)的相互作用研究。

  DeCipher:分子稳定性分析的工具。通过分析动力学过程中分子各种性质的变化,分析分子整体或局部的稳定性。

 ·生物大分子结构模建与性质分析

  Biopolymer:构建和调整生物大分子的结构,包括蛋白质、多肽、核酸及糖类。可通过替换、添加或删除残基来对多肽结构进行调整;可以构建多肽的主链结构,并用旋转异构体库优化侧链构象;可以将蛋白质结构分隔为子结构域,让用户自动检测并设定任何蛋白质的结构域。还可以让用户构建和搜索蛋白质结构数据库。

  Homology:蛋白质同源模建模块。根据蛋白质的氨基酸序列在PDB库中搜索同源蛋白质模板,预测、模建此蛋白质的三维结构。还可以做蛋白质及核酸的序列比对(两两对比或多重序列对比)、多个蛋白的三维结构比对、数据库同源搜索、loop区搜索及模建、二级结构预测、蛋白质亲疏水性分析、结构模型优化、结构模型合理性评估和模拟突变研究等等方面。用Homology模建的蛋白质模型可用于药物设计或作为X衍射和NMR实验中结构精修的起点。Homology中模建的模型可用InsightII软件包中其他程序进行结构精修和分析。

  Modeler:自动的蛋白质建模工具,用户只需提供一个与目标序列同源的有三维结构的蛋白质信息,MODELER可以自动比对并模建出目标序列的三维结构。利用CHARMm 力场,在模建过程中对空间约束和立体化学几何都进行了优化,所以MODELER是一个极为精确的模建工具。

  Profiles-3D:提供一个蛋白质反向折迭的结构预测方法,采用UCLA的David Eisenberg教授的实验室创立发展的方法。可用来评判模拟结构的合理性,并标示错误折迭区域,为蛋白质结构模建和结构改造提供合理性评估手段。

  SeqFold:基于序列的相似性和结构的相似性寻找同源序列的工具。用常规的序列比较软件不能检测到的同源性较低的蛋白质序列,SeqFold可以敏感地发现它们的关系。SeqFold得到的折迭模板和比对可以用在MODELER或Homology等模块中,来模建蛋白质的结构,可以为蛋白质的功能研究提供有用的信息。这些信息能够使研究者更集中地进行突变实验以检查和提高模型,这比传统的突变实验节省更多时间和精力。

   DelPhi:分子表面静电势分析的工具。在不同的溶液条件下计算分子表面静电势,分析活性位点的结合作用,帮助用户正确处理配体-靶点之间的相互作用。例如,在药物设计中,DelPhi程序帮助用户确定配体-靶点相互作用的结合区域,进而更集中、准确地进行药物分子的设计,加速药物研发过程。通过分析分子表面静电性质,可帮助用户确定定点突变的pKa效应、结合能量、催化率等。计算得到的静电性质可以在分子表面图示化。通过三维势能面,用户可以估测蛋白质内部及表面的静电势。进行实验前的化合物筛选,同时帮助用户模拟实验,为用户节省时间和经费去得到最佳的化合物。

  Binding Site Analysis:寻找蛋白质的活性位点,并预测蛋白质功能的工具。该模块提供两种方法寻找蛋白质的活性位点。一是通过对蛋白质表面几何形状分析来寻找能与底物结合的口袋,预测可能的结合位点;二是通过对蛋白质家族在进化过程中的保守氨基酸进行研究,并确定这些氨基酸残基在三维结构中的位置,预测蛋白质的活性位点。再利用基于结构的药物分子设计软件(Ludi, MCSS, Affinity)将小分子对接至该活性位点。活性位点确定以后,可在PDB库中搜寻与活性位点有相同特征的已知蛋白质来预测未知蛋白的功能。

 ·基于靶标结构的药物设计

  Affinity:是一个自动、灵活的分子对接程序。该模块自动地完成靶点与配体的对接。对于给定的包含有配体分子和靶点分子的复合物模型, Affinity程序通过计算配体-靶点复合物的能量来自动地寻找配体与靶点的最佳结合模式,这种基于能量计算的寻找方法特别适用于在实验无法确定配体- 靶点复合物结构时,进行基于结构的药物设计。Affinity程序允许用户自由定义蛋白靶点结合位点的柔韧程度,以及配体构象来研究上述势能的变化。特别适合精确筛选活性肽或活性有机小分子。

  Ludi :全新配体设计工具。可设计新的先导化合物或对已有化合物进行改造。Ludi可以通过靶点的结构信息或者一系列结合配体的结构信息来推测潜在的靶点结合位点,通过搜索InsightII提供的小分子碎片库(用户也可以根据需要自行扩充碎片库),Ludi将碎片进行拼接来得到一系列与靶点结合位点互补的化合物,得到的化合物可以通过计算其与靶点的非键相互作用来筛选得到先导化合物。在靶点结构未知的情况下,Ludi通过将一系列配体进行迭合,可以推测配体与靶点的相互作用位点,并进行数据库搜寻以得到与靶点有较好结合的配体。

  MCSS:用于配体结合部位分析和表征的模块,它也是一个基于结构进行小分子药物设计的工具,可以单独使用或与Ludi联用。与Ludi的不同之处在于,它是基于能量计算的工具,所以它必须与CHARMm模块共同使用。

  Search/Compare:生成及比较不同分子的构象特征,用户可以根据分子场及体积,进行两个甚至多个分子的迭合,系统检索立体构象特点。

 ·核磁共振结构测定

  NMR Refine DGII:NMR Refine DGII为NMR波谱学工作者提供了根据NMR数据计算和评价生物大分子三维结构所需的全部工具。利用DGII(距离几何)方法解析NMR数据得到分子的三维结构,并用Restraint/Structure Evaluation Database 和ProStat (Protein Structure Analyst)进行精确分析。模块自带的NMR Database提供了大量的命令协调谱学数据和模型数据。

   NMR Refine Advanced:与NMR Refine DGII 相比,NMR Refine Advanced提供了许多互补和高级的工具。包括NMR Database, MD Schedule, NOE-MD, IRMA, NOE Simulate, Restraint/Structure Evaluation, ProStat, Query 等。

hyman 发表于 2007-8-22 21:21

[size=2][color=#FF0000]谁安装成功了?请分享安装经验!我在使用小鱼儿的方法安装时,出现错误提示,放入第二张光盘时没有反应,不能继续安装,请帮忙分析解决,非常感谢![/color][/size]

--------------
附:

insightII2005 在 RedHat Enterprise Linux Advance Server 4 Update 4 下安装成功   
  发布者:小鱼儿   发布时间:2007/04/21 星期六(Saturday) 00:19 AM      

  多天的努力奋斗终于下载完了verycd上的insightII 2005,正好今天
在 AS4 U4(RedHat Enterprise Linux Advance Server 4 Update 4) 下
安装成功,把自己的过程写在这里,希望能对有需要的朋友有帮助.
**********************************************************
在 AS4 U4 下 Insight2005 安装过程
(在/usr/accelrys/2005 目录下安装 Insight2005)
过程如下:
1.打开两个终端,一个准备以root身份执行命令,称ROOT终端
        一个准备以普通用户jackie身份执行命令,称jackie终端
在ROOT终端,分别执行如下命令:
chown jackie /usr
chgrp jackie /usr
mount /dev/cdrom /mnt/cdrom  
2.在jackie 终端,分别执行如下命令:
  mkdir -p /usr/accelrys/2005
  cd /usr/accelrys/2005
  ls /mnt/cdrom
  /mnt/cdrom/install
  注:A:安装进程开始后,提示 setenv DISPLAY 0:0 问题时,直接回车
   B:提示license时,输入n再回车就行,其它问题就是输入y再回车了
   C:后续安装过程按照提示和默认设置执行就可以,对于其出现的
    错误提示可以不理睬,而选择continue
3.在需要第二张光盘时,在ROOT终端执行: umount /mnt/cdrom
  待光驱放入光盘后再执行: mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
4.安装过程全部完成后,在jackie终端执行:
source /usr/accelrys/cshrc
source /usr/accelrys/License_Pack/msi_lic_cshrc

5.在jackie终端执行:
在jackie的主目录下
vi .chsrc,然后加入命令行:source /usr/accelrys/cshrc,存盘退出.
source  .cshrc
6.在jackie终端执行:
在/usr/accelrys目录下,安装由I2005.1L_install_overlay.gz
解压缩后的补丁程序
  ./I2005.1L_install_overlay.gz
7. 将第一张安装盘里crack目录下的msi_i2005.lic后,
  改名为msilicense.dat
  然后放在/usr/accelrys/License_Pack/license 目录下
8.jackie终端重复再执行上述步骤4里的命令
9.至此全部安装完成,执行insightII 即可成功
注意:以上操作全是在csh 环境下完成!  
  
经过连续几天的日夜下载,终于在今天上午下载完毕,又经过一上午的试验,终于在RHEL AS4上安装成功Isight II2005,现在把我在安装过程中出现的一些问题给大家附在后面,希望对大家有所帮助.
先把我的系统简单介绍一下:我用的是VMWARE 5.0版,在其上安装了RHEL AS 4.0版.其他的按照说明来就可以了,有以下几点需要注意:
1。用csh进行命令执行,不要用系统默认的bash进行命令执行。只需要在终端命令窗口中执行csh就可以了。
2。系统需要两个补丁:([url]ftp://194.199.20.114/linux/redhat/7.3/en/os/i386/RedHat/RPMS/openmotif21-2.1.30-1.i386.rpm[/url]);
([url]ftp://194.199.20.114/linux/redhat/8.0/en/os/i386/RedHat/RPMS/compat-libstdc++-7.3-2.96.110.i386.rpm[/url]),安装之前先把这两个补丁打上.
3。emulet提供下载的InsightII2005的破解补丁有问题,安装完之后需要对其中的一个文件进行修改。accelrys/License_Pack/licenses这个文件夹下面有一个文件msilicense.dat。用文本编辑器gedit打开后,把文本中的permanentuncounted全部修改为permanent,然后保存就可以了。

kl128 发表于 2007-8-23 09:38

Insight II 2005的安装 (转贴)


  根据研究的需要,我需要使用在Linux平台下运行的Insight II,最初的想法是,不就是一个软件而已吗,肯定可以轻松搞定。但是当我安装完成Red Had 9.0的时候,我的想法变了,怎么我突然连电脑都不会用了,为什么我连电脑上东西都找不到了,苦苦的郁闷了一个晚上。更不要说安装Insight II。
  经过大约一周的煎熬,Linux基本入门了,又经过了一周的煎熬,Insight II安装失败了!!!
  不过吉人自有天象,我找到了张羲煌老师的学生小张,是他帮助我最终完成了安装软件的任务,回忆我们共同战斗的夜晚。
  网上也又Insight II的安装成功教程([url]http://www.bokele.com/index.php[/url] CH=Log&ArticleID=36062),不过我们的实验是不成功的,但是我们在它们的基础上,通过自己的摸索,安装成功了,下面是我们的安装步骤,共享出来,有问题大家一起交流吧。

软件环境为 Linux Enterprise Advanced Server U4
软件为Insight II 2005
安装目录 /usr/accelrys/2005


过程如下:

1 在ROOT终端,分别执行如下命令:
/bin/csh
mount /dev/cdrom /mnt/cdrom  
mkdir -p /usr/accelrys/2005
cd /usr/accelrys/2005
ls /mnt/cdrom
2 /mnt/cdrom/install
  注:A:安装进程开始后,提示 setenv DISPLAY 0:0 问题时,直接回车
   B:提示license时,输入n再回车就行,其它问题就是输入y再回车了
   C:后续安装过程按照提示和默认设置执行就可以,对于其出现的
    错误提示可以不理睬,而选择continue
3. umount /mnt/cdrom
  待光驱放入光盘后再执行: mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
4.source /usr/accelrys/cshrc
source /usr/accelrys/License_Pack/msi_lic_cshrc

5.在root的主目录下
vi .chsrc,然后加入命令行:source /usr/accelrys/cshrc,存盘退出.
source  .cshrc
6. 在/usr/accelrys目录下,安装由I2005.1L_install_overlay.gz
解压缩后的补丁程序(该文件在软件的主页中下载[url]http://www.accelrys.com/solutions/it/[/url])
  ./I2005.1L_install_overlay.gz
7. 将第一张安装盘里crack目录下的msi_i2005.lic后,
  改名为msilicense.dat
  然后放在/usr/accelrys/License_Pack/license 目录下
8.再执行上述步骤4里的命令
9.至此全部安装完成,执行insightII 即可成功


整个安装大约40分钟,现在已经开始用它工作了。
切记,操作系统一定要一致,为刚开始就是在Redhat 9.0下安装的,不成功。

hyman 发表于 2007-9-3 12:22

[color=#FF0000]我完全按照以上方法安装,可是执行insightII命令还是毫无反应,既没有图形界面,也没有文字提示。以下是我的安装记录(Root终端),请大侠帮忙分析解决,非常感谢![/color]
[quote]
[root@localhost ~]# /bin/csh
[root@localhost ~]$ mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
mount: block device /dev/cdrom is write-protected, mounting read-only
[root@localhost ~]$ mkdir -p /usr/accelrys/2005
[root@localhost ~]$ cd /usr/accelrys/2005/
[root@localhost 2005]$ ls /mnt/cdrom
bin      config     help   irix6m4      msi_lp_6.5.2.tar.Z
biosym_bin   copyright.txt ibm   Linux_2_Intel_32 products.dat
biosym_setcon crack     install lp652_setup.exe  README
CHECKSUM    data      irix6m3 lp_setup
[root@localhost 2005]$ /mnt/cdrom/install

WARNING: It is not recommended to install the software
as root because of possible security problems.

Do you still want to continue? (y/n) [n] y

IMPORTANT for REMOTE installations: If you are using a display
remote to the machine you are using for the installation, the
DISPLAY environment variable must be set to your local display
while using the Accelrys Installation Utility.

Your current DISPLAY setting is :0.0

Is DISPLAY set correctly? (y/n) [y]: y

**************************************************************************
*                                    *
*         RESTRICTED RIGHTS LEGEND               *
* Use, duplication, or disclosure is subject to restrictions stated   *
* in your contract on file at Accelrys Inc.               *
*                                    *
* THESE PROGRAMS AND ALL SUBROUTINES, DATA, AND FILES USED BY    *
* THEM ARE PROTECTED BY COPYRIGHT AND HENCE MAY NOT BE USED, COPIED,  *
* MODIFIED, TRANSMITTED, INSPECTED, OR EXECUTED BY ANY MEANS INCLUDING  *
* THE USE OF ELECTRONIC DATA PROCESSING EQUIPMENT, XEROGRAPHY, OR  *
* ANY OTHER METHODS WITHOUT THE EXPRESS WRITTEN PERMISSION OF THE  *
* COPYRIGHT HOLDER.                           *
*                                    *
* Copyright (C) 2005 Accelrys Inc.                    *
*          10188 Telesis Court                 *
*          San Diego, CA 92121 USA               *
*                                    *
**************************************************************************

5442 MBs available in /usr/accelrys/2005 mounted on /


*** IMPORTANT *** Accelrys Files will be installed in both:

   /usr/accelrys (root directory)

   and

   /usr/accelrys/2005 (release context directory)

NOTE: You can modify the root directory path during installation
   to account for NFS mounted directories if necessary.

Is it ok to install files in the above directories? (y/n): y

Starting Accelrys License Pack setup tool /mnt/cdrom/lp_setup...

Accelrys License Pack version 6.5.2

An Accelrys License Pack is required for this Accelrys Release. A License Pack
is a centralized location for all license management tools as well
as the license file to support multiple Accelrys Releases. The Accelrys LicensePack tools and files are contained in the directory License_Pack.
Please refer to the Accelrys License Guide for details on how to make
sure all of your Accelrys releases use the same License Pack.

If you have not already installed an Accelrys License Pack, we recommend
that you do so. To install or update a License Pack follow the prompts
below.

Looking for License_Pack directory in /usr/accelrys

Accelrys License Pack not found.


Do you already have the Accelrys License Pack installed? (y|n|q) [n]: n

By default, the Accelrys License Pack will be installed in

/usr/accelrys/License_Pack

Do you wish to use this path? (y|n|q) [y]: y

The License Pack requires 70 MBs of disk space
and this disk has approximately 5442 MBs available.


Installing Accelrys License Pack in /usr/accelrys/License_Pack...
License_Pack/bin/
License_Pack/bin/accelrys_support
License_Pack/bin/checkHost
License_Pack/bin/chk_exp_lic.pl
License_Pack/bin/config_license_pack
License_Pack/bin/config_named_users
License_Pack/bin/demo_server
License_Pack/bin/ds_get_lic_conf
License_Pack/bin/extra
License_Pack/bin/extra.pl
License_Pack/bin/filter_lic.pl
License_Pack/bin/gen_demo_license
License_Pack/bin/get_comp_num
License_Pack/bin/get_diagnostics
License_Pack/bin/get_license
License_Pack/bin/get_os
License_Pack/bin/get_sysid
License_Pack/bin/get_token_usage
License_Pack/bin/install_license
License_Pack/bin/lic_compare
License_Pack/bin/lic_log
License_Pack/bin/lic_log.pl
License_Pack/bin/lic_renamer
License_Pack/bin/license_verifier
License_Pack/bin/lm_assistant
License_Pack/bin/lmenv_switch
License_Pack/bin/lmgetldpath
License_Pack/bin/lmgetpath
License_Pack/bin/lmgetplat
License_Pack/bin/lmsetup
License_Pack/bin/lmup
License_Pack/bin/lmup.biosym
License_Pack/bin/lp_conf_setup
License_Pack/bin/lpver
License_Pack/bin/lpver.pl
License_Pack/bin/make_opt_file.pl
License_Pack/bin/merge_demo_lines.pl
License_Pack/bin/merge_license
License_Pack/bin/msi_lmboot
License_Pack/bin/msi_lmdown
License_Pack/bin/msi_lmreread
License_Pack/bin/msi_support
License_Pack/bin/obtain_license
License_Pack/bin/prime_lmup
License_Pack/bin/rc.msi_lmboot
License_Pack/bin/rename_lic
License_Pack/bin/rm_demo_lines
License_Pack/bin/rm_old_msilm
License_Pack/bin/set_host
License_Pack/bin/set_host.pl
License_Pack/bin/unset_host
License_Pack/bin/unset_host.pl
License_Pack/config/
License_Pack/config/.sys_chk
License_Pack/config/LIC_CONFIG.tmpl
License_Pack/config/LIC_DATA
License_Pack/config/biosym_setcon
License_Pack/config/cshrc_platform
License_Pack/config/lp_cleanup
License_Pack/config/lp_ldenv
License_Pack/config/lp_lmenv
License_Pack/config/msi_lic_cshrc.tmpl
License_Pack/config/msi_lic_echovars
License_Pack/config/msi_lic_profile.tmpl
License_Pack/ibm/
License_Pack/ibm/exe/
License_Pack/ibm/exe/MSI_Token_verifier
License_Pack/ibm/exe/biosym
License_Pack/ibm/exe/feature_verifier
License_Pack/ibm/exe/feature_verifier_950
License_Pack/ibm/exe/filemod_unixtime
License_Pack/ibm/exe/get_license_file
License_Pack/ibm/exe/lic_check
License_Pack/ibm/exe/lmgrd
License_Pack/ibm/exe/lmutil
License_Pack/ibm/exe/msid
License_Pack/ibm/exe/product_reporter
License_Pack/ibm/exe/unixtime
License_Pack/ibm/exe/vlfu
License_Pack/ibm/exe/what_cpu
License_Pack/ibm/libs/
License_Pack/ibm/libs/libls_license01.so
License_Pack/ibm/libs/libls_license01s.so
License_Pack/irix6m3/
License_Pack/irix6m3/exe/
License_Pack/irix6m3/exe/MSI_Token_verifier
License_Pack/irix6m3/exe/biosym
License_Pack/irix6m3/exe/feature_verifier
License_Pack/irix6m3/exe/feature_verifier_950
License_Pack/irix6m3/exe/filemod_unixtime
License_Pack/irix6m3/exe/get_license_file
License_Pack/irix6m3/exe/lic_check
License_Pack/irix6m3/exe/lmgrd
License_Pack/irix6m3/exe/lmutil
License_Pack/irix6m3/exe/msid
License_Pack/irix6m3/exe/product_reporter
License_Pack/irix6m3/exe/unixtime
License_Pack/irix6m3/exe/vlfu
License_Pack/irix6m3/exe/what_cpu
License_Pack/irix6m3/libs/
License_Pack/irix6m3/libs/libls_license01.so
License_Pack/irix6m3/libs/libls_license01s.so
License_Pack/irix6m3/libs/libpub_lic.so
License_Pack/irix6m3/libs/libpub_lic_clover.so
License_Pack/irix6m4/exe/
License_Pack/irix6m4/exe/MSI_Token_verifier
License_Pack/irix6m4/exe/biosym
License_Pack/irix6m4/exe/feature_verifier
License_Pack/irix6m4/exe/feature_verifier_950
License_Pack/irix6m4/exe/filemod_unixtime
License_Pack/irix6m4/exe/get_license_file
License_Pack/irix6m4/exe/lic_check
License_Pack/irix6m4/exe/lmgrd
License_Pack/irix6m4/exe/lmutil
License_Pack/irix6m4/exe/msid
License_Pack/irix6m4/exe/product_reporter
License_Pack/irix6m4/exe/unixtime
License_Pack/irix6m4/exe/vlfu
License_Pack/irix6m4/exe/what_cpu
License_Pack/irix6m4/libs/libls_license64_01.so
License_Pack/irix6m4/libs/libls_license64_01s.so
License_Pack/irix6m4/libs/libpub_lic_64.so
License_Pack/sun5/
License_Pack/sun5/exe/
License_Pack/sun5/exe/biosym
License_Pack/sun5/exe/feature_verifier
License_Pack/sun5/exe/feature_verifier_950
License_Pack/sun5/exe/filemod_unixtime
License_Pack/sun5/exe/get_license_file
License_Pack/sun5/exe/lic_check
License_Pack/sun5/exe/lmgrd
License_Pack/sun5/exe/lmutil
License_Pack/sun5/exe/msid
License_Pack/sun5/exe/product_reporter
License_Pack/sun5/exe/unixtime
License_Pack/sun5/exe/vlfu
License_Pack/sun5/libs/
License_Pack/sun5/libs/libls_license01.so
License_Pack/sun5/libs/libls_license01s.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/feature_verifier
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/get_license_file
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/lmgrd
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/lmutil
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/msid
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/product_reporter
License_Pack/Linux_2_Intel_32/exe/vlfu
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_license01.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_license01s.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01i.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01i7.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01i7s.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01i8.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01is.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_01s.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_64_01i7.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_g01.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_licenseRH7_g01s.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libls_license_p.so
License_Pack/Linux_2_Intel_32/libs/libpub_lic.so
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/feature_verifier
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/get_license_file
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/lmgrd
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/lmutil
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/msid
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/product_reporter
License_Pack/OSF1_4_Alpha_64/exe/vlfu
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License_Pack/Policies/20030603124200
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License_Pack/Policies/20030709113100
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License_Pack/Policies/20031030055033
License_Pack/Policies/20031114115036
License_Pack/Policies/20031125122823
License_Pack/Policies/20031208030235
License_Pack/Policies/20031208032125
License_Pack/Policies/20040422010146
License_Pack/Policies/20040427075352
License_Pack/Policies/20040427082138
License_Pack/Policies/20040609085300
License_Pack/Policies/20040709100826
License_Pack/Policies/20040726124401
License_Pack/Policies/20040727040457
License_Pack/Policies/20040728032012
License_Pack/Policies/20040728121701
License_Pack/Policies/20040729075939
License_Pack/Policies/20040729080724
License_Pack/Policies/20040729085635
License_Pack/Policies/20040824103439
License_Pack/Policies/20040922043435
License_Pack/Policies/20040922123017
License_Pack/Policies/20041004102826
License_Pack/Policies/20041004111237
License_Pack/Policies/20041006040350
License_Pack/Policies/20041006041650
License_Pack/Policies/20041108104708
License_Pack/Policies/20041110073128
License_Pack/Policies/20041110084143
License_Pack/Policies/20041119075731
License_Pack/Policies/20041215070601
License_Pack/Policies/20041220124520
License_Pack/Policies/20041220124612
License_Pack/Policies/Legacy_Policy
License_Pack/Policies/LicensingAPI
License_Pack/Products/
License_Pack/Products/ProductPolicies.xml
License_Pack/data/msilicense.data.file
License_Pack/data/imd.dat
License_Pack/data/legal.txt
License_Pack/data/lp_version.lic
License_Pack/data/LicensePack.version_data

Configuring /usr/accelrys/License_Pack...

Copying install script...

Copying bin/special directory...

Copying data/special directory...

Copying config/special directory...

Copying Linux_2_Intel_32/exe/special directory...

---------------------- DOCUMENTATION INFO -----------------------

The most complete version of all Accelrys product documentation is
maintained on Accelrys' web site, at [url]www.accelrys.com/doc.[/url] This site
includes the most current release notes, various search options,
and if desired, tools to help licensed users download documentation
sets for local access. If you are a customer or consortium member
and don't have a password to access this documentation,
please contact [email]support-us@accelrys.com[/email].


Starting Accelrys Installation Utility...
[1] 5480
[root@localhost 2005]$ mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
mount: block device /dev/cdrom is write-protected, mounting read-only
[root@localhost 2005]$ source /usr/accelrys/cshrc
[root@localhost 2005]$ source /usr/accelrys/License_Pack/msi_lic_cshrc
[root@localhost 2005]$ cd ~
[root@localhost ~]vi .cshrc
[root@localhost ~]$ source .cshrc
[root@localhost ~]$ cd /usr/accelrys/
[root@localhost accelrys]$ /root/I2005.1L_install_overlay

Your existing InsightII 2005 installation has been verified.
InsightII 2005.1L Patch installation is about to begin.

Do you still want to continue? (y/n) [n]
y

InsightII 2005 overlay installation complete.

[root@localhost accelrys]$ source /usr/accelrys/cshrc
[root@localhost accelrys]$ source /usr/accelrys/License_Pack/msi_lic_cshrc
[root@localhost accelrys]$ insightII
[root@localhost accelrys]$
[/quote]

lyttj66 发表于 2008-1-19 16:44

怎么没有下文了?

hiwin 发表于 2008-2-12 14:41

个人建议最好不要在root用户下安装,这个习惯不好。
安装信息里面也提示了:WARNING: It is not recommended to install the software as root because of possible security problems.
小鱼儿的安装方法是可行的,第5步,vi .chsrc这里应该为 vi .cshrc,可能是作者笔误。
另外执行insightII 命令启动时,要确认是在csh下。

我是在RedHat Enterprise Linux Advance Server 4 Update 2版本下用iso文件硬盘载入安装通过,测试功能正常。

jackiespring 发表于 2008-2-19 14:40

好东西,啊看看

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