请问哪位兄弟有sybyl的安装文件？兼讨论一下安装
[size=3][font=黑体][color=#FF0000]看了一下，网上公布的大多是verycd上的下载连接，以这个速度下5gb的文件不知道要下到什么时候，而且没有说明是否为破解版，以及安装的操作系统（unix,linux等等，众说纷纭）。请问哪位兄弟下载并安装了sybyl?如愿意共享，愿出1000金币酬谢！
另外，看了一下，关于sybyl的安装网上基本没有非常明确的教程，因此我们开一个专题讨论吧，大家就sybyl的安装和使用有什么经验，欢迎讨论！[/color][/font][/size] 我已成功安装sybyl7.3，教程正在写，等一下发上来与大家交流 [s:47] 安装平台可为redhat 9, rhel4,rhel5, linux as3, linux as4等，官方推荐的平台为rhel4
sybyl7.3共4个cd
打开第一个终端
＄su
password
#mkdir -p /biosoft/tripos
#chmod -R 777 /biosoft/tripos/
#mkdir -p /usr/local/flexlm/licenses/
#chmod -R 777 /usr/local/flexlm/licenses/
放入第一个cd
#mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
#ls /mnt/cdrom （查看cd1中的文件）
#cp /mnt/cdrom/crack/license.dat /biosoft/tripos/
此时开第二个终端,目的是在普通用户下安装sybyl7.3
＄/mnt/cdrom/install.sh
出现安装界面
安装目录选/biosoft/tripos/sybyl/
license文件选择/biosoft/tripos/里面的,不选/mnt/cdromcrack/里面的是因为 后面的做法影响接下来的umount.
浏览器选/usr/bon/mozilla
提示换cd2时候,在第一个终端里:
#umount /dev/cdrom
弹出cd1，放入cd2
#mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
点击"proceeding"继续
提示换cd3时候,在第一个终端里:
#umount /dev/cdrom
弹出cd2，放入cd3
#mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
提示换cd4时候,在第一个终端里:
#umount /dev/cdrom
弹出cd3，放入cd4
#mount /dev/cdrom /mnt/cdrom
安装完毕后,在在第一个终端里:
#umount /mnt/cdrom
#ls /biosoft/tripos/AdminTools10.8/tables/(确认里面存在license_file与否,如果没有,用文本编辑器打开后面说到的license.dat,然后另
存为license_file)
#cp /biosoft/tripos/license.dat /usr/local/flexlm/licenses/
#cd /biosoft/tripos/AdminTools10.8/bin/linux/
#./lmgrd triposlm
#/biosoft/tripos/sybyl/bin/linux/sybyl
（本安装方法是在发哥的基础上变化而来） 我有sybyl7.2 和sybyl7.3 在我的maze上 账号6350287 昵称 sunshine 为大家开放 要是关闭的话 qq找我要 176904005 欢迎大家来 关于sybyl安装的补充说明
在安装linux时，最好全安装所有软件包（这样安装不会出问题）
如果是双系统，最好选择手动分区，/目录最好在20g以上
另外，
[url]http://forum.e2002.com/read.php?tid=109978[/url]
"普通教程帖,每个5威望;具有代表水平的教程帖,每个10威望"
p版，已经证明我的教程是成功的，给点威望吧 [s:47] 嗯，按照兄弟的方法，已经成功，待回校与大家分享经验，感谢kl128兄弟和haoming0027兄弟，请版主转移给haoming0027兄弟1000金币，聊表谢意！论坛有这样积极热心的会员，真是药学区之福，鸭鸭之福阿！ [s:47] [s:47] Sybyl的安装教程网上已有很多。redhat 9下安装好象不会成功。RHEL4绝对没有问题。
不知谁可以提供一下使用方法的中文教程。英文教程内容太多，太繁杂，得花很多时间去读。 kl128的教程使用很多Linux命令，对于不熟悉Linux的人来说还是很难看懂。实际上RHEL为桌面版，可以完全不用命令而直接利用鼠标就可以安装。
另外，安装也不需要对硬盘进行分区，完全可以在windows下利用虚拟机进行安装、使用。
如果哪位用过sybyl的战友能写一个中文的使用说明（主要是对接）的话，在下愿意来一个图文并茂的傻瓜式的安装教程。 指出两个问题，与楼上的兄弟讨论
1. “redhat 9下安装好象不会成功”
这句话是错误的，我和pengyao0616兄都成功安装了，pengyao0616兄弟也有些体会，可能不久就会发上来。
2. “完全可以在windows下利用虚拟机进行安装、使用”
可以这样做，但是，现在的硬件资源本来就不够用，虚拟机也只能是玩一下小的计算或者做个教程之类的，不能满足真正的科研计算
3.“如果哪位用过sybyl的战友能写一个中文的使用说明（主要是对接）的话，在下愿意来一个图文并茂的傻瓜式的安装教程。”
看样子，兄弟有点不见兔子不撒鹰的味道，我看兄弟不妨大方点，先把自己的东西贡献给论坛，到时候自有人帮助你。
以上几点，不知是否妥当，请兄弟指正。 我这儿用redhat 9安装sybyl的确实出了问题(我用的是redhat 9光盘)。
在windows下用虚拟机安装的好处在于，可以与windows共享文件夹。例如，你可以用chemoffice画出化合物结构，存为mol2格式，放在共享文件夹中，然后sybyl直接调用。而不用反复重启切换操作系统。
既然大家现在都可以安装成功，我看再写什么教程意义不是太大。倒是建议大家多讨论讨论使用方法。
[s:80]
[quote]引用第8楼kl128于2007-10-08 19:07发表的 :
指出两个问题，与楼上的兄弟讨论
.......[/quote] [quote]引用第9楼oringyoung于2007-10-09 11:22发表的 :
我这儿用redhat 9安装sybyl的确实出了问题(我用的是redhat 9光盘)。
在windows下用虚拟机安装的好处在于，可以与windows共享文件夹。例如，你可以用chemoffice画出化合物结构，存为mol2格式，放在共享文件夹中，然后sybyl直接调用。而不用反复重启切换操作系统。
既然大家现在都可以安装成功，我看再写什么教程意义不是太大。倒是建议大家多讨论讨论使用方法。
[s:80]
.......[/quote]
兄弟说的这个问题其实在双系统中也不复杂，linux下可以挂载window分区，直接读取其中内容，可以先在windows下将结构准备好，进入linux启动sybyl调用即可，也不算太复杂。
至于虚拟机得问题，赞同kl128兄的看法，作为熟悉操作系统以及软件是可以的，不过如果想真正体会linux，觉得还是直接装双系统比较好一点。而且一开始在linux下会碰到很多问题，虽然麻烦，但是却可以帮助自己思考问题，尽快上手。如果一切都太顺利了，等真正碰到问题的时候也许会措手不及。
经过几天的摸索，觉得linux的功能还是很强大的，windows下的基本功能都可以实现，决定先暂时玩一阵linux再说[s:110] 文件要时常备份，我的rhel4出了问题，算了一个月的东西全没有了，55·········· 嗯，楼上兄弟提醒了我啦，呵呵 是mm哦 [s:110] 按上面大哥的方法出现下面的情况：
Copying install files...
Copying python files...
Unzipping python files...
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
File "/dsw/testing/pbondi/scratch/sybuny70_wh/cd1a/linux_python/lib/python2.1/lib-tk/Tkinter.py", line 1285, in __call__
return apply(self.func, args)
File "/usr/tmp/TA_INSTALL3182/installDlg.py", line 415, in doInstall
self.install()
File "/usr/tmp/TA_INSTALL3182/installDlg.py", line 639, in install
self.installIt(x)
File "/usr/tmp/TA_INSTALL3182/installDlg.py", line 749, in installIt
self.installItHere(product, self.taroot, self.plats)
File "/usr/tmp/TA_INSTALL3182/installDlg.py", line 852, in installItHere
os.execl(tmpDir+"gztar.sh","gztar.sh",cdname)
File "/dsw/testing/pbondi/scratch/sybuny70_wh/cd1a/linux_python/lib/python2.1/os.py", line 259, in execl
execv(file, args)
OSError: [Errno 2] No such file or directory
Xlib: unexpected async reply (sequence 0x385f)!
ga ga该怎么解决啊？小女子求救...... [quote]引用第14楼xudingwen于2007-11-06 11:08发表的 :
按上面大哥的方法出现下面的情况：
Copying install files...
Copying python files...
Unzipping python files...
Exception in Tkinter callback
.......[/quote]
这个问题我也遇到过,那是因为你的lilux是个人零售版,里面有很多库文件没有,我换成企业版lilux 就解决了, redhat9.03是可以的 请问哪可以找到使用教程呢?装上之后却不会用,请问怎样去除蛋白质复合物中的配体和水分子呢 为保险起见，仍然强力推荐RHEL 4。 求助sybyl7.3安装教程
希望有这个的兄弟共享一下！
电驴下载速度太慢了！
[url]http://forum.e2002.com/read.php?tid=199837[/url] [s:94] 请问在UBUNTU系统上能安装吗？ [quote]
[s:94] 请问在UBUNTU系统上能安装吗？[/quote]
不能。这个操作系统我试过，体积小，性能好，完全免费；但不能安装sybyl。RHEL很大，但没办法。 [quote]
不能。这个操作系统我试过，体积小，性能好，完全免费；但不能安装sybyl。RHEL很大，但没办法。[/quote]
thanks ! [quote]引用第4楼kl128于2007-10-01 09:09发表的 :
关于sybyl安装的补充说明
在安装linux时，最好全安装所有软件包（这样安装不会出问题）
如果是双系统，最好选择手动分区，/目录最好在20g以上
另外，
.......[/quote]
我是在RHEL5下安装的。按照你的方法，安装到
#./lmgrd triposlm
这一步，一切正常， 但在安装目录/biosoft/tripos/sybyl/bin下只有unix目录，没有linux目录。而且里面也没有sybyl文件。所以无法执行
#/biosoft/tripos/sybyl/bin/linux/sybyl
请问如何解决？急盼回复。谢谢！
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