鸭绿江学术资源论坛's Archiver

Custom Search

jolin31911 发表于 2007-10-23 22:43

autodock ~我轉貼之前我的問題(kl128->請幫我個忙 )

cygwin安装好后windows的<开始〉/<程序〉中会有, 启动B SHELL, 输入命令 % AUTODOCK4 -P *.dpf -l *.dlg & 就可以进行分子对接计算,条件是你必须首先安装好cygwin, python2.4和adt, *.dpf 为你已经准备好的分子对接参数文件

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
大大 我想問一下 ADT 圖形介面 是否在完成 GPF與DPF 要執行autodock4 與 autogrid4
計算它 是否應該要再另一個地方執行
(我把auodock4.exe autogrid4.exe與所有參數都放在那個資料夾
但直接在run->autodock or autogrid 是不行跑的 )


---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
之前大大所提到的:
cygwin安装好后windows的<开始〉/<程序〉中会有, 启动B SHELL, 输入命令 % AUTODOCK4 -P *.dpf -l *.dlg & 就可以进行分子对接计算

启动B SHELL, 输入命令 -----> 這邊可以在說明一下嗎 我不太清楚

B SHELL->程式語言的介面嗎 還是.....?
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

我已經都把所有文件 都準備好了 只是要跑dock與grid 想得到dlg與glg 文件 一直得不到 目前連跑的程序都有問題 請大大解答一下

lyywpp 发表于 2007-10-24 00:46

[s:90] [s:90] [s:103]

kl128 发表于 2007-10-29 20:46

你把受体文件,配体文件,参数文件,autodock, autogrid都放到cygwin中同一个目录下,在cygwin下运行,得到结果可以用adt分析,如果adt是安装在windows下的,你也可以将计算用到的,和产生的文件都拷贝出来,放到windows的一个目录下,进行分析

kl128 发表于 2007-10-29 20:48

再问一下,是先跑autogrid, 再跑autodock的吗?

建议你到autodock网站,下个manual看看

页: [1]

Powered by Discuz! Archiver 6.1.0  © 2001-2007 Comsenz Inc.