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haoming0027 发表于 2007-12-5 09:17

sybyl7.3问题？？

大家好，我想请教一下，在网上下载的sybyl7.3中的QSAR模块好用吗？我用molconn-z时候，根据manual上的步骤，刚刚做到gzip -cd $TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz | tar xvf - 这一步，执行这个命令，确实解压了，但是In the Read File dialog, select cocaine.mol2. 取小分子的时候，却提示没有发现cocaine.mol2 ，这是 怎么回事啊？

还有，这个 sh命令是什么意思啊，是跳到sybyl所在的目录吗？molconn-z.tar.gz在那个目录啊？解压之后又是在哪？

还有，哪位战友，按照manual，把QSAR模块做完了，是不是可以完全按照manual做啊？

真心希望，有经验的战友们，给我个帮助，在这先谢了！

smallbean 发表于 2007-12-5 11:33

没打用过QSAR
不过sh可以解释，在sybyl的命令行格式下，键入sh，后面的命令就表示正常的shell下命令，因为sybyl的命令行格式和普通shell不一样，需加sh转换一下

pengyao0616 发表于 2007-12-7 00:10

呵呵可惜没有用过这个模块

kl128 发表于 2007-12-7 23:42

sh 表示你将进行的工作在c-shell下完成

wgd1220 发表于 2007-12-9 14:21

sybyl7.3 是什么东西？

pengyao0616 发表于 2008-1-14 23:15

comfa是好用的，呵呵

tfnju 发表于 2008-1-16 10:52

可以用啊，在图形界面下做的，没有任何问题，结果也是和book shelf一致的

tjegg 发表于 2008-1-16 21:57

manual没有问题。

haoming0027 发表于 2008-3-12 08:55

谢谢 大家 答复  知道了

roderjers 发表于 2008-3-22 20:23

我也 学习了！！！！！！！！！

hw9550 发表于 2008-3-24 08:13

CoMFA和CoMSIA是好用的，别的没试过

在黑暗中奔跑 发表于 2008-3-29 22:13

我感觉sybyl7.3在做结构优化是有点小问题[sad]

fangzheng1012 发表于 2008-3-31 17:10

[biggrin] [biggrin]

tuguoying 发表于 2008-4-25 14:35

回复 3# pengyao0616 的帖子

请问哪位仁兄有sybyl7.3有教程啊？能否给我发一份？急啊！[email]tugy2007@163.com[/email]

tuguoying 发表于 2008-4-27 22:13

回复 4# kl128 的帖子

请大侠帮忙
我再用sybyl7.3的FlexX做对接时，提交作业后弹出两个对话框：
一个写的如下
FlexX was unable to create the active site file and/or theprotein
single_site.pdb
single_protein.pdb
另一个写的如下
Requested Cscore related files could not be built

而在testport中显示的提示是
Preparing CScore related files...
/bin/bash: csh: command not found

请问一下这是什么原因造成的？怎么修改？？？

tuguoying 发表于 2008-4-27 22:16

关于sybyl中的对接模块FlexX

请大侠帮忙
我再用sybyl7.3的FlexX做对接时，提交作业后弹出两个对话框：
一个写的如下
FlexX was unable to create the active site file and/or theprotein
single_site.pdb
single_protein.pdb
另一个写的如下
Requested Cscore related files could not be built

而在testport中显示的提示是
Preparing CScore related files...
/bin/bash: csh: command not found

请问一下这是什么原因造成的？怎么修改？？？

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