真核生物基因组重复序列的几个相关概念
大卫星DNA(macro-satellite):也称经典卫星DNA。真核生物DNA在CsCl密度梯度离心时除形成一个主要的宽带外,还会出现浮力密度不同的条带,这些条带中的DNA称为卫星DNA。这是由于某段DNA分子中存在大量重复序列,DNA的G+C含量不同于主带的缘故。
小卫星DNA(minisatellate)
是由中等大小的串联重复顺序构成,分布在所有染色体,又可分为高度可变的小卫星DNA和端粒DNA。前者重复单位约9~24bp,重复次数变化很大,呈高度多态性,称为可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeat,VNTR)。其核心序列是GGGCAGGAXG,可能与DNA的同源重组有关。
微卫星DNA(micro-satellite)
是一类更简单的寡核苷酸串联重复序列,其重复单位为2~6bp,重复次数10~60次左右,其总长度通常小于150bp,分布在所有染色体上,又被称为短串联重复序列(short tandem repeat,STR)。常见的是以(AC)n和(TG)n的二聚核苷酸为重复单位,存在于内含子、间隔DNA中,也可以存在于编码区,编码区的重复顺序均为3个碱基组成的重复单位。微卫星DNA由于重复单位的重复次数不同而具有高度的遗传多态性,并且遵照孟德尔的遗传规律,可以作为很好的遗传标记。
回文序列的结构特点和功能;
英文:palindrome,回文结构序列是指顺读和倒读都一样的序列,是最常见的一种真核生物DNA 反向重复序列,绝大多数限制性内切酶的识别位点是回文结构序列,许多蛋白质调控因子的顺式作用元件包含回文结构序列,而且这些回文结构序列一般都出现在增强子中,回文序列如果出现在终止子之前,它可以有效提高RNA聚合酶Ⅲ合成mRNA的活性。总之,目前大多数报道回文结构序列与基因表达的调控有关。
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