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usermxy 发表于 2008-3-5 10:10

有好用的DNA序列拼接软件吗

各位大虾，

我是一个分子生物学实验新手。

现在所做课题涉及大量引物设计、测序、拼接、比对和聚类分析，数据处理工作量很大。

我比较头疼的是PCR产物拼接和校对，不知道有什么方法和软件等可以比较方便、迅速、准

确地实现这个目的，如果能实现批处理就最好不过。

还有，如果用PCR产物测序，最后寻找引物序列时，一定要引物序列和模板100%匹配才能认

为测序结果可靠吗？有些测序公司人员说只要有连续6个碱基能匹配就可相信测序结果了，

有什么根据吗？

saturn100 发表于 2008-3-5 18:36

i suggest DNA star, or vector NTI to you, maybe you could have a try

wangxuexia 发表于 2008-4-1 09:48

DNA star是个很经典的软件，可是试一试

ccf821020 发表于 2008-5-3 17:16

Sequencher 4.7（序列拼接软件）
http://www.bio88.cn/download/bencandy.php?fid-4-id-30-page-1.htm

这个不错!!

harchine 发表于 2008-5-3 23:03

contig express

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