读文献思路--集锦----汇
无论医生还是生命科学研究者,这些都是需要终身学习的工作,在这其中阅读文献是必不可少的功课之一。在大家秉烛夜读的一个个夜晚,面对pubmed里文献的海洋,有哪一篇点燃了你的灵感,让你的实验在山重水复疑无路之时,有了柳暗花明又一村的进步;又有哪一篇文献让你有了豁然开朗茅塞顿开的感觉,更有哪一篇文献否定了你的设想,让你的工作滑向了失败的边缘。
无论酸甜还是苦辣,请把你的感受化成一串串文字,与我们分享。
注:本贴所有内容均为转贴、整理,感谢这些文献阅读心得的原创者!!!-----kl128
[[i] 本帖最后由 kl128 于 2008-3-23 13:45 编辑 [/i]] 许多人读文献全文的方法都是总结其中的实验方法、设计思路,但这种读法错过了锻炼科研能力的宝贵机会。每篇文献都是作者科研思维的体现。在读文献时应以积极参与的心态去读,而非被动接受。
具体方法是,拿到想读的全文,请不要一口气读完。读摘要时最重要的是弄清其实验目的,这时请停下来根据实验目的由自己设计实验思路和方法,最好能动笔写下提纲。然后去读原文,与作者的原版进行对比和印证,找出自己和文献中的缺点和不足。初期基本都是自己的思路有缺点,久而久之就能找到文献中的问题了。相信那时你的科研能力已经有了质的飞跃。这种读法就像部分参与了作者的实验设计,如能长期坚持,对培养科研思维的好处不言自明。
一点心得,仅供参考。 对于每个做研究的人来说,不管你是什么行业,是什么专业方向,文献是你在遇到问题时候的一盏“指路明灯”。虽然我们的工作是创新的,但是离不开前人的经验教训,离不开他们的辛勤劳动。所以认真阅读文献、合理认识文献、掌握文献精髓、灵活应用知识对每个人来说都很需要。这正是“文献的力量”!当然正如版主所说,我这里讲的“文献”并不是狭义的文献,而是广义的,可以是古人的典籍、国外的报道、前人的经验、老师兄长的传授,甚至可以是街坊邻里的“生活常识”。记得本科时候上生药学选论的时候,老师说道青蒿素。这是从中药青蒿中提取的有过氧基团的倍半萜内酯药物。正是因为《本草纲目》中记载青蒿需“取汁熬膏”,所以研究的时候才放弃了植化提取分离的传统方法——有机溶剂提取。这个例子告诉我们一定要懂得领会,学会发掘典籍中的亮点。
但是不是所有的文献我们都应当“全盘接受”呢?
我在硕士阶段课题工作中也遇到了这样的问题。羚羊角主要应用于高热惊厥的症状,一般采用原粉吞服。在前期的文献查阅中,有很多报道其水提取液具有良好的解热作用,有的甚至报道按羚羊角的水解后的氨基酸比例重新配制纯氨基酸口服液也同样具有良好的解热作用。但是在实际实验过程中,我们发现羚羊角的解热作用并非针对传统的COX-2发热。而且也并不是复合氨基酸作用的单一效果。所以我们在认真学习文献的同时,还需要有“辩证”的观点。只有正确的认识文献,才可以更好的利用文献。
MlxHan 读文献不要迷信作者的实验设计。有时作者的实验设计是有缺陷的,或者里面的数据本来就有问题的。
有些文献实验设计很简单,不够严密,自己也可以加以修改。 这个话题好!我就是通过一篇文献让我转变了思路,找到了突破口。
刚开始实验时,我预将骨髓间充质干细胞诱导为肝细胞。
我提取大鼠骨髓细胞,用文献中常用的诱导体系培养,一般7-10天后,可以看到少数细胞分化为类圆形,可能是所谓的肝样细胞,但决大多数仍自发分化为成纤维样细胞或胞内有很多脂肪颗粒的梭形细胞,再养也不会向类圆形变化了,传代后更是连原有的极少数类圆形细胞也不见了。重复了多次,一直是这种情况,将这种情况下的混杂细胞行PCR、免疫组化检测肝细胞样表型,为阴性。
说实话,那个时候的我,急坏了,郁闷的要死,因为这是我整个实验的基础,做不出来就不能进行后续实验。
在我一次又一次失败实验3个月后,突然看到了一篇国外文献报导称,由于至今尚未确立最佳的骨髓干细胞分化为肝细胞的体外诱导培养体系,众多骨髓干细胞在体外能诱导分化为肝细胞的研究都只说明了这一现象存在的可能性,但究竟分化比例多大、纯度如何尚无定论,而且移植入体内的细胞类型较杂,故不利于客观分析。而β2m-/Thy-1+的骨髓干细胞亚群不经培养,新鲜分选后即具有肝细胞样表型,可作为后续实验的种子细胞。
我看后大喜,决定改变方法,运用免疫磁珠细胞分选法分选出肝干细胞亚群。
实验结果证实,直接使用免疫磁珠分选法分选出的β2m-/Thy-1+细胞亚群经PCR和免疫荧光鉴定肝细胞样表型,均为阳性。后续的实验我就是使用了这类细胞完成的。
可以说我最后是受上述那篇文献的启示转变方案完成了课题。我的真实经历和改变策略希望给大家一点点启示和借鉴。多看文献,永远不断的更新文献,你一定会从中找到解决问题的方法,会从中发现亮点、灵感甚至突破。
蓝铃 认为在进行文献阅读时应考虑以下几点:1、不要枯燥的去翻译阅读,强迫自己。而要把它作为一个故事,梳理它的脉络和思路,了解它的情节和关键人物。学校一位海龟开一门文献阅读课,上课人巨多,他就像讲解一段故事、一段经历一般,娓娓道来,效果不必多说;2、要给自己压力 看了一篇文献 要强迫自己进行交流,到主席台去PPT,看了一个月要能整理成一篇综述,看了三个月,要想者发SCI的综述(当然困难很大)。3、贵在精,而不在多 可以现多在摘要中选择,摘要的好坏非常见功力,直接体现文章的水平。 我来谈谈我对文献的理解
首先还是声明,我现在是一个刚刚大四的学生,可能有些说法有点不够专业,不过请大家尽情的拍砖。
我觉得文献是一个双刃剑。要看你怎么利用。好的文献,可能对自己的课题有很大的帮助。那些垃圾文献可能会对自己的研究造成很大的阻碍。文献毕竟是别人的东西,可能会对你的思想造成桎梏。我学过小提琴的,学了十几年。我老师给我的一个很大的感触就是在开始学一个新曲子之前,千万不要听别人的演绎。否则你不知不觉会让自己的风格跟录音资料里面的风格一样,这样自己就没有创新点或者自己就没有演绎的个性。做学问也一样。文献毕竟是很陈旧的东西,即使是再新的文献,也是别人几年前的工作。从创新来看,已经没有意义了。但是他毕竟是一个高度,一个标竿。就像你是在站在别人的肩上,让你自己更加高大。
其次,我们在学习文献的时候,一定要有所批判。不一定别人做的东西就是完全正确的。本来做学问就是一个争鸣的事情。记得金满文教授说过的一句话:所谓的学说,就是大家学着说。学说不是定理,肯定有其历史或者其他因素的局限性。所以一定要批判的看待文献。
看文献,一定要多多看英文的文献。大家其实都知道,内心非常清楚,中文的文献有多少是可以信赖的。我自己就读过不少的所谓的核心期刊的文章,很多数据都是不充分或者是前后矛盾的。有些讨论都很牵强。国内只要有钱,想发哪里就发哪里。而且论文是跟职称挂钩的。所以这样的文献很没意思。而且很多学者把一个课题分成很多很多份文章来发。这些弊病我不多说了。一句话,国外的文献相对好一些。
再者,不要尽信文献。很多文献涉及保密或者专利的问题,所以关键数据不会写上去的。即使是自己的文章,一些关键的东西千万不要写真实的。记得学药剂课的时候,老师讲过一个惨痛的例子。老外来中国,想购买一个化合物的合成工艺。花了多少多少千万都没有谈妥。结果,在最后一天,即将达成协议的时候,老外接到别人的电话,立刻说,我们不买了。原来啊,我们的合成工艺已经发表在文章里面了。文章都公开了。所以这损失了多少啊!小日本就是很狡猾的。他们很多数据其实是故意写错的。这样你去照所谓的文献去做,做出来才怪呢!
我还有一个看文献的一个很大很大的心得就是文献可以不要看全文。很多人到处到处的求文献的全文。如果是关键的文献,求全文是很应该的。如果是所有的文献你去求,那就很没有必要了。多花时间啊!而且不是所有的文献都有帮助。想想啊,看文献,一般的只用浏览摘要就可以了,真的!只用知道结果就行了。只有你特别需要的文献,才要好好的读。这个话也是金教授的观点。我读的时候,把所有的摘要放在一个文档里面,把结果用红色一标,非常醒目。需要直接去找。
先说这么多吧!我虽然是一个小本科,不过我大二就去了实验室,做了一些东西,也学到了很多很多(所以不要瞧不起我说的东西哦!)。要是我明年读研了,我就把我更多的心得跟大家分享啊!
也算一个抛砖引玉吧!大家继续踊跃发言哈!
甲醛 文献的力量大无穷,我深有体会
先说写作。
在写作英文文章的时候,如果你手头有足够的全文,写起来就轻松很多。比如“方法和材料”这一部分,大量的借鉴吧,没有问题,当然你不要一字不变。碰到语法问题怎么办?有办法!把你手头数十篇全文用acrobat pro合并成一篇,然后搜一搜,怎么样?——往往会找到类似的表达。我的英文文章都是自己写的,一大半的语法问题都是这样搞定的。
课题选择。
做课题最重要的是什么?——不跟别人重复。如果你做完实验才发现别人早就发过这种文章了,那只有后悔的份。所以在选择课题的时候,要注意pubmed检索文献“不遗漏”,很多人宣称自己可以做到这一点,实际上不见得,一个中文意思,英文可以有几种甚至几十种表达方法。
实验设计。
结果的检测,用何种方法往往让人费神。比如“两种方法体内成骨能力的定量比较”,用什么方法来检测才可以发比较好的文章?空想是不行的,道听途说是不行的,看中文文章也是不行的,怎么办呢。你得检索同类SCI文献,然后把他们用的方法列举出来,看看目前国际上普遍用的哪种方法,这样你才能定论。就我的经验而言,影响因子越高的文章,用的检测方法越简单、越成熟。
再比如细胞增殖的检测,一般都想到用MTT或者倍增时间,实际上呢?这两种方法极少出现在SCI文章里,目前常用的是增殖倍数、DNA总量....看一篇两篇文献是没用的,要把多篇文献归纳起来,总结出一个国际公认的检测方法。
重要提示。
我们课题组要求定期汇报一篇IF20以上的文献,虽然大多数都没什么实质的用途,但总有那么一两篇文献会给你新的思路。我们组内就有几个课题是根据这种文献汇报引申而来的,极具创新意识,甚至提出了很多与传统不一样的观点。 文献的力量除了启发idea,及时的纠正思路和开辟新的实验途径外,另外还有一点,本人深有体会:学习实验方法和分析实验中遇到的问题。
大部分实验技术,尤其是经典的实验技术,一般而言在Pubmed上都有大牛写的相关综述,而且多半不止一个大牛写过。这些综述会涉及到实验过程的方方面面,及前人在这个技术上碰到过的问题和解决的方法。尽可能的弄到全文,如果在做实验前仔细看看这些内容,会很好的避免重犯前人的错误,而少走弯路,对实验进程的加快大有帮助。人家要做十次八次才做得出理想的结果,而你能三四次甚至第一次就就能拿到好实验结果,那是一件多么惬意的事啊。也避免了在园子里发帖子问来问去的。
大部分文献根本没必要去看全文,每方面的只要看那么一两篇经典的文献就足已,当然如果你的时间多得不知道怎么打发的除外,呵呵。这些经典的文献要有回头复习的习惯,没有人敢说自己能够过目不忘吧,要不看了一次又忘了还不等于没看。并且每看一次就要做些标记。现在的pdf专业版的都可以在上面做标记,这个功能可要好好的利用起来。 最近一段时间,我看到大家一直在讨论看文献以及如何看文献的问题。我觉得我个人的经验是:
1,最好不要看中文的文献。我从来没有看过中文的文献,可能有一个原因是我这个方向国内作的很少。我个人觉得中文的文献有很多漏洞甚至错误的地方,作为科普读物可能还算合格。但是作为一种参考好像是不太合适。再说,咱们毕业一般要求是要发sci,我也没有见过sci引用中文的文献的。
2,看英文的文献不要怕难,要坚持下去。刚开始的时候没有一点基础,偏偏我还是作理论的,那叫一个费劲。两三天才能看完一篇文献。我刚开始的时候坚信的“书读百遍,其意自现”,但是我后来发现是我一直在原地踏步。后来我发现我思考的结果是没有结果。于是我就再看另外的文献,就这样慢慢走来,速度越来越快。后来我发现我以前不会的东西差不多都明白了。我觉得《劝学》里面的一句话“吾尝终日而思矣,不若须臾之所学也”是多么的正确了。
3,看文献要多多益善。我以前看到有的同学问看文献要看多少?我的回答是多多益善。试想一篇文献至少要有三两可取之处,看得多了你的水平自然就上来了。我自己从研一就开发新方向,没有什么人能帮助我,我靠的只有文献。我还记得我那半年每天至少3-5篇文献,后来略有小成。我师兄更牛--每天三篇文献。现在他才博士二年级(硕士读了两年),很多方面超过了我们老板,要知道我们老板也是973首席!他现在体系是自己找的,这半年发了两篇PRB(做物理的同学知道这个不是很容易的)、一篇JPCM,其中JPCM被评为06年100篇最佳文章之一,供全世界免费下载一年。他告诉我这些成果很多都是看文献得来的,其中包括做东西的思路和写文章的英文表述等等。
4,要批判的看文献。随着时间的增长,文献看得越来越多,我们会发现很多文献彼此是矛盾的。很多人不知道怎么办?这个就要要求我们要批判的看文献--用审稿人的眼光看他。他有那些可取之处,哪些不好。我们也不能极其推崇一个观点,要思考一下为什么有人支持另外的观点。忘记谁说的,比较牛的科研人员是能够同时容纳两种相左观点的人。这样我们才能学到更多的东西 老大的文章多多拜读哦,体会不小啊
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