分子进化与系统发育
<P>分子进化与系统发育</P><P>【原 书 名】 Molecular Evolution and Phylogenetics </P>
<P>【原出版社】 Oxford University Press </P>
<P>【作 者】（美）Masatoshi Nei, Sudhir Kumar </P>
<P>【译者】 吕宝忠 钟扬 高丽萍 等</P>
<P>【出 版 社】 高等教育出版社 </P>
<P>【书 号】 7040112043 </P>
<P>【出版日期】 2004 年5月 </P>
<P>【开 本】 16开 </P>
<P>【页 码】 299 </P>
<P>【版 次】1-2 </P>
<P>第一章进化的分子基础. </P>
<P>1.1生命的进化树 </P>
<P>1.2进化机制 </P>
<P>1.3基因的结构与功能 </P>
<P>1.4DNA序列的突变 </P>
<P>1.5密码子使用频率</P>
<P>第二章氨基酸序列的进化演变 </P>
<P>2.1氨基酸差异和不同氨基酸的比例 </P>
<P>2.2泊松校正(PC)和厂距离 </P>
<P>2.3自展法的方差和协方差 </P>
<P>2.4氨基酸的替代矩阵 </P>
<P>2.5突变率和替代率</P>
<P>第三章DNA序列的进化演变</P>
<P> 3.1两个序列间的核苷酸差异 </P>
<P>3.2核苷酸替代数的估计 </P>
<P>3.3厂距离 </P>
<P>3.4进化距离的数值估计 </P>
<P>3.5核苷酸序列的对位排列 </P>
<P>3.6进化距离估计中有关序列间隔的处理</P>
<P>第四章同义与非同义的核苷酸替代 </P>
<P>4.1进化通径方法 </P>
<P>4.2基于Kimura双参数模型的方法</P>
<P> 4.3密码子3个不同位置的核苷酸替代 </P>
<P>4.4用于密码子替代模型的似然法</P>
<P>第五章系统发育树 </P>
<P>5.1系统发育树的种类 </P>
<P>5.2拓扑差异 </P>
<P>5.3构树方法</P>
<P>第六章系统发育推断：距离法 </P>
<P>6.1UPGMA</P>
<P> 6.2最小二乘(LS)法 </P>
<P>6.3最小进化(ME)法 </P>
<P>6.4邻接(NJ)法 </P>
<P>6.5用于系统发育重建的距离测度</P>
<P>第七章系统发育推断：最大简约法 </P>
<P>7.1寻找最大简约(MP)系统树 </P>
<P>7.2MP树的搜索策略 </P>
<P>7.3一致树 </P>
<P>7.4分支长度的估计 </P>
<P>7.5力口权简约法</P>
<P> 7.6用于蛋白质数据的MP法 </P>
<P>7.7共享的遗传特征</P>
<P>第八章系统发育推断：最大似然法.. </P>
<P>8.1ML法的计算过程 </P>
<P>8.2核苷酸替代模型 </P>
<P>8.3蛋白质似然法 </P>
<P>8.4ML方法的理论基础 </P>
<P>8.5给定拓扑结构的参数估计</P>
<P>第九章系统树的精确性和统计检验 </P>
<P>9.1最优原理和拓扑结构误差 </P>
<P>9.2内部分支检验 </P>
<P>9.3自展检验 </P>
<P>9.4拓扑结构差异的检验 </P>
<P>9.5不同树树方法的优缺点</P>
<P>第十章分子钟与线性树 </P>
<P>10.1分子钟假说 </P>
<P>10.2相对速率检验 </P>
<P>10.3系统发育检验 </P>
<P>10.4线性构第</P>
<P>十一章祖先核苷酸与氨基酸序列 </P>
<P>11.1祖先序列推断：简约法 </P>
<P>11.2祖先序列推断：贝叶斯方法</P>
<P> 11.3祖先分支中的同义与非同义替代 </P>
<P>11.4趋伺进化和平行进化</P>
<P>第十二章遗传多态性和进化</P>
<P> 12.1遗传多态性的进化意义 </P>
<P>12.2等位基因频率数据的分析 </P>
<P>12.3再分群体中的遗传变异 </P>
<P>12.4多个基因座位的遗传变异 </P>
<P>12.5DNA多态性 </P>
<P>12.6检测自然选择的统计检验</P>
<P>第十三章用遗传标记构建群体树 </P>
<P>13.1等位基因频率数据的遗传距离 </P>
<P>13.2限制性酶的DNA序列分析 </P>
<P>13.3RAPD数据分析</P>
<P>第十四章展望 </P>
<P>14.1统计方法 </P>
<P>14.2基因组计划 </P>
<P>14.3分子生物学与进化</P>
<P>参考文献</P>
<P>附录</P>
<P> </P>
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