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[有机合成] 药学初学者文献检索小科普

一、产品化学信息:
包括药品名、英文名、CAS登记号、化学结构、物理性质、分子式和分子量等信息。
1.一般可以在通用搜索引擎上找到。如百度www.baidu.com,谷歌www.google.com

2. MARTINDALE药典
由英国皇家药学会出版,收录了5300多种化学物质及6万种制剂和25个国家的7000多家生产商的信息。通过简便方法可快速地检索药品的用法、作用、化学式和制造商的商标名称。
提供比较全面的药品基本信息:
Generic drug names, including US, British, and international approved names 通用名,包括美国、英国和国际批准的名称。
Synonyms/chemical names 化学名
Molecular formula/molecular weight分子式/分子量
CAS registry numbers, Read codes, ATC codes CAS登记号
Pharmacopoeias, including pharmacopoeial description 药典,包括药品说明书
Adverse effects and their treatment 副作用和疗效
Precautions, including contra-indications 禁忌症
Interactions 药物相互作用
Pharmacokinetics 药物代谢动力学
Uses and Administration, including pharmacology and dosage 用法用量
Preparations and brand names剂型和商品名
进入光盘数据库,点击Martindale,进入后,右侧有快速检索,在检索栏输入检索词即可。还可以进行浏览检索等。


高级检索可选择想要搜索的全部或部分内容。如查询Cefteram Pivoxil的副作用:


3. Ensemble数据库
涵盖了药物的基本信息:分子式、化学名、公司代码、通用名、商标、工业和其它资源、注册信息、药物治疗活性和作用机制、研发阶段、CAS登记号、专利信息、相关文献资料和会议资料等等。
检索途径:进入光盘数据库,点击Ensemble,进入后选择Search,弹出Search by,下拉菜单中有Product、Patent、Reference、Classification、Text五个子目录,在Product下可通过款目号、药品名、化学名、分子式等字段进行检索。在专利目录下,可通过专利号、专利名、申请日期、优先日期等字段进行检索。另外,还可以利用AND/OR进行逻辑组配检索。点击Reset可重新设定检索方法和检索词。点击search and display 可显示检索结果的具体内容。

二、药理学及临床研究情况:
  包括药物作用机理、药物代谢动力学、临床疗效及安全性、适应症、不良反应等。
这一项目下各个信息的查询主要可利用通用搜索引擎检索,中文数据库如重庆维普、万方、CNKI等;英文数据库如MARTINDALE药典、PDR、Highwire、MEDLINE等。下面介绍我们所拥有的资源:

1.  重庆维普www.cqvip.com
我所进入维普的途径:
①  在中国医药化工网首页www.chinayyhg.com,输入用户名和密码进入会员专区,点击“中国期刊文献资源”,然后选择你想要进入维普的入口。
②  进入光盘数据库,点击“医药资源信息系统”。
  检索方式有:快速检索、传统检索、分类检索、高级检索、期刊导航。
支持字段检索和组配检索。提供题名、关键词、题名或关键词、文摘、刊名、作者、第一作者、参考文献、分类号、机构和任意字段等11个字段进行检索,并可实现各个字段之间的组配检索。2007年新增“基金资助、栏目信息和作者简介”等 3个检索入口。
其检索功能有:二次检索、逻辑组配检索、中英文混合检索、繁简体混合检索、精确检索、模糊检索,可限制检索年限、期刊范围等。
在检索导航界面,可选择想要检索的范围。选择“R医药、卫生”,检索的内容就限定在这一专业科目内。
检索策略:如果只用药物名称检索,可能得到的结果会很多。这时候我们要采取一些逻辑组配检索或二次检索。
例如:查找头孢他啶的临床资料,可以采用“头孢他啶*药理学”、“头孢他啶*(副作用+不良反应)”、“头孢他啶*药代动力学”、“头孢他啶*药效学”、“头孢他啶*适应症”等等逻辑组配。其中,“*”表示逻辑与,即“AND”;“+”表示逻辑或,即“OR”。

2.  MARTINDALE药典

3.  PHYSICIANS' DESK REFERENCE 医师药物参考书
主要包括处方药、非处方药和眼科用药三个部分。包括2800种FDA核准的处方药、最常用的非处方药及眼科用药的交互作用、副作用、建议用量、临床药学、儿科用药和配伍禁忌等。
可通过药品商品名或通用名,制造商,分类查询,适应症,禁忌症,副作用,图片和化学结构等进行检索。

可以通过限定检索范围进行查询。如在”Search Request”栏目下,输入”Cefixime”,点击”Category”可选择限定查询类别;点击”Topic”亦可进行限定。另外,还可利用”AND”、”OR”和”NOT”进行逻辑检索。在”Search Options”栏目下可选择自然语言、模糊匹配、设置最大显示数。点击Search后,在”Search History”中可找到结果。


4.  Medline
Medline数据库是世界公认的权威医学数据库,是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)编辑出版的国际综合生物医学信息数据库。
(1)  利用Pubmed中的medline数据库。
采用Mesh主题词检索法检索某一药物,搭配副主题词: administration and dosage、adverse effects、analogs and derivatives、analysis、 antagonists and inhibitors、blood、cerebrospinal fluid、chemical synthesis、chemistry、contraindications、diagnostic use、economics、immunology、isolation and purification、metabolism、pharmacokinetics、pharmacology、poisoning、radiation effects、standards、supply and distribution、therapeutic use、toxicity、urine等,只要在想要查询的一项前勾上副主题词,可以检索到对应的投药和剂量、副作用、类似物和衍生物、分析、拮抗剂和抑制剂、血液、脑脊液、化学合成、化学、禁忌症、诊断应用、经济学、免疫学、分离和提纯、代谢、药代动力学、药理学、中毒、辐射作用、标准、供应和分配、治疗应用、毒性、尿等各类信息资料。
另外,还可在Pubmed首页选择点击Clinic Queries。在Clinical Queries的主页上列有常用的临床类目,如therapy(治疗)、diagnosis(诊断)etiology(病因)和prognosis(预后)。在检索框内输入检索词,然后点击上述类目即可。 Clinical Queries提供Sensitivity(检出相关文献)和Specificity(检出密切相关文献)两种检索方式。
(2)利用光盘数据库218.1.68.113中的Medline光盘数据库进行检索。
进入Medline途径:先登陆光盘数据库,进入后最好先安装插件和补丁,然后点击Medline,开始---程序---winSPIRS--- winSPIRS。选好需要的数据库年份,我们所拥有的是从1966年到2003年11月份的数据。确认后进入检索主界面。
检索方法有自由词检索、主题词检索、索引检索和浏览文献。下面介绍较常用的前两种。
Ⅰ自由词检索
在主检索界面状态下,就是用自由词检索。(或点击“Search”,或按功能键F2进入该界面)。数据库中的自由词来源于所有记录基本字段的单词、词组、数字、字符组合等(默认状态下进行所有非限定字段检索)。输入检索式后,按回车即可检索。
其检索式的形式有:
①任意字母或数字组合:1986,abc等
②任意的单词或词组:cancer,hepatitis B等
③连缀词组:Interleukin-6,c-fos等
④词根(截词)检索:chemo*,chromat*等
⑤通配符检索:c?me
⑥检索以前检索式:“#1”、“#2”
⑦逻辑检索式:cancer  AND therapy
⑧限字段检索:PCR in TI
  Ⅱ主题词检索
在主窗口下点击”Thesaurus”或按功能键F9进入。主题词检索是通过主题词表Thesaurus进行的,它由轮排索引、主题词信息和副主题词表组成。Medline使用的是《医学主题词表》(Medical Subject Headings)。主题词是反映文献内容特征的并经过规范化了的词或词组。
副主题词:对主题词进行限定的规范化的词,现有82个。其中和药物能够匹配的副主题词有:
AD  Administration&Dosage 投药和剂量;
AE  Adverse Effects     副作用;
AI  Antagonist&Inhibitors  拮抗剂和抑制剂;
CT  Contraindications    禁忌症
PK  Pharmacokinetics    药代动力学
PC  Pharmacology      药理学
对于检索结果目录中的内容,可通过Options进行选择。有Abstract、Author、Title、Source等字段可供选择。将结果保存到本地盘中,也可通过Options选择想要保存的字段内容。
举例:查找1997年以来有关阿莫西林的用法用量和副作用的文献。
①在Thesaurus下输入amoxicillin,单击look up,在轮排表中找到主题词为amoxicillin。---- #1
②单击search now,弹出副主题词选择框,选择AD Administration-and-Dosage和AE Adverse Effects。---- #2
③在search下输入py>2001(即把时间限制在2001年之后)。---- #3
④将 #2 and #3,得结果。然后选择要输出的字段,保存到本地盘中或打印。

5.  International Pharmaceutical Abstracts,IPA 国际药学文摘
IPA是美国药师协会编辑出版的著名药学文献书目数据库,收录了1970年以来全世界出版的750多种药学、医学及卫生保健相关期刊的药学文献题录和文摘。涉及的主要学科领域有:药物信息、药学、药物化学、制药、微生物学、药理学、药物副作用、毒理学等。收录范围也包括临床药物信息、技术药物信息、药房实践、药学教育、制药工业政策与法规等信息。
我们所拥有的是光盘数据库,检索方法与MEDLINE光盘数据库相同。

6.  Toxline 毒理学文献数据库
Toxline是美国国家医学图书馆收录药物与化学物质之毒物学、药理、 生物医学与生理学的影响文献资料库。资料库特性:TOXLINE资料取自16种免版税权之资料库,如Medline、 DART、Biosis、IPA等资料库。涉及的主要专题领域有:药物副作用、空气污染、化合物的致癌作用、药物毒性、食品污染、职业危害、杀虫剂与除草剂、毒理学分析及水处理等等。
进入Toxline途径:先登陆光盘数据库,点击Toxline,开始---程序---winSPIRS--- winSPIRS。选好需要的数据库年份,确认后进入检索主界面。我们所拥有光盘数据库目前只更新到2001年。检索方法与MEDLINE光盘数据库相同。
检索可以题名、摘要、关键词进行检索,化学物质可以CAS注册号进行检索。

7.  Inpharma 新药信息全文库
Inpharma Database是美国Adis国际出版公司编辑出版的最新药物信息全文数据库。该库主要收录了关于新药物、治疗突破、药物经济学、R&D、药物反应、药物应用的发展趋势及卫生保健政策等方面的评论性、总结性的报告,是药物研究开发、临床应用人员及药品制造商不可缺少的信息检索工具,所提供的信息具有很高的商业价值。
  我们所拥有的是光盘数据库,检索方法与MEDLINE光盘数据库相同。

8.  Highwire
检索途径
(1)基本检索
  基本检索界面分为上下两个区,即检索策略输入区和检索结果的限定区。检索策略可在输入区中选择"Authors"、" Keywords "、"Year, Vol, Page "等字段输入,再利用限定区,HighWire-hosted 期刊 或 HighWire-hosted 期刊与Medline限定条件检索
(2)高级检索(Advanced Search)
  如果需要进行更详细的检索,在基本检索的界面中,点击左侧的"Advanced search Form"进入高级检索界面。
高级检索界面分为5个区,最上面可根据期刊出版年限,卷数,页码进行检索。第二区根据Author ,title ,abstract /title ,fulltext/ abstract /title范围检索。第三区是期刊范围限定区为HighWire-hosted journalas, HighWire-hosted journals + Medline ,Journals selected from list at bottom of page.第四区为时间限定区,从可查询从1948年到现在的全文或评论性文章。第五区为检索结果形式。
  浏览途径:
  (1)浏览所有期刊根据研究领域浏览,为生物学,自然科学,医学,社会科学四大领域。
  (2)浏览HighWire-hosted journalas,根据期刊的首字母顺序。
注:刊名后标注为:Free back issues——可以免费获得过刊的全文,时间从3个月前到两年前,各刊不一。Free trial period——可以在试用期内获得全文。Free site——可以获得该刊的所有全文。

三、知识产权情况
主要通过专利网检索
中国专利信息检索系统http://www.cnpat.com.cn/search.asp
中华人民共和国知识产权局专利检索http://www.sipo.gov.cn/sipo/zljs/
中国医药化工网http://www.chinayyhg.com 中的专利文献
美国专利商标局网站http://www.uspto.gov/patft/index.html
欧洲专利http://ep.espacenet.com
光盘阅览室中的Pharmaprojects、Ensemble、Brands数据库
Brands数据库 由美国Engel Publishing Partners出版。本光盘将专利药物的市场份额、销售额及专利终止日期等制药工业界最感兴趣的信息汇集在一起,共包括3978个药物,涉及商品名、化学名、治疗类别、适应证、剂型、剂量、上市国家、上市情况、上市时间、1998-2015年间专利到期药物、销售商、广告商、市场状态、1997年至今的销售额。可从产品名、商品名、化学名、治疗类别、适应证、开发状态、产品类型、专利到期年份、销售商、剂型等11种途径进行检索,检索相当便捷。
检索方法:进入光盘数据库→点击Brands, 主要有两种检索方式,Search和Browse。

四、国外研发及上市情况
1. 通用搜索引擎
2. FDA http://www.fda.gov/
3. Pharmaprojects 数据库
PharmaProjects数据库涵盖了目前研究开发中的新药最完整的综合性信息,监控着世界范围内处于开发中的每一个新药。对申报研究课题、审议开发新药及生产可行性报告等有重要参考价值。每月更新。
内容:
①  研究开发中的药物信息:药物基本信息、药物开发公司的情况、药理数据、化学数据、专利情况、各国上市情况、主要事件、开发进度和细节信息;
②  开发厂商及科研信息;
③  治疗领域药品信息;
④  广泛上市或中止开发的药品及许可转让信息;
⑤  化学结构及化合物的药理活性信息。
进入途径:进入光盘数据库→点击PharmaProjects V5→点击Accept进入,有多种检索方式可供选择:Tree Search(树状检索)、Browse Search(浏览检索)、Form Search(分子式检索)、Structure Search(结构检索)、Trend Analysis(趋势分析)、Company Profile(公司信息)、Therapy Profile(治疗信息)。
Tree Search/树状检索:有十二个子目录,每个目录有子标题,每个子标题为一检索途径。Drug Name、Drug Name Includes等都可做检索途径。
检索策略、检索结果目录、具体结果都可以通过Export保存到本地硬盘中。
举例1:检索全球范围内,2000年后首次上市的抗感染药物。
策略:
点击Activity Data,选择Therapy Grouping=Anti-infective Products;
点击Major Events,选择Major Event=First Launches,选择Major Event Data=after 2000-1-1。
点击clear可以删除本次所有检索式,点击delete删除单个检索式。使用Search History可以保存检索式。
将三个检索条件以逻辑“And”组合检索,点击Search,再点击Results可看到检索结果。点击Export将结果目录保存到带$的盘中,将会自动生成excel表格。选择一个结果点击Profile可查看详细情况,点击Export将结果目录保存到带$的盘中,将会自动生成word文档。
举例2:检索2005年后辉瑞研发上市的抗感染药物。
策略:Originator=Pfizer AND Therapy Grouping=Anti-infective Products AND Major Event=First Launches AND Major Event Data=after 2005-1-1. 得到1个检索结果。

4. Ensemble数据库

五、国内研发及申报情况:
通用搜索引擎;
SFDA http://www.sfda.gov.cn/
丁香园药学数据库http://db.dxy.cn/

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