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Kozak序列--一个重要的名词

Kozak sequence
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。
(在真核起始过程中,由Met-tRNAi,eIF-2和GTP形成了三元复合体(ternary complex)再结合40S小亚基形成前起始复合物(preinitiation complex)。此复合物的形成分为二步:首先GTP和eIF-2结合,以增加此因子与Met-tRNA.结合的效率。然后三元复合体再与40S亚基结合。核糖体结合位点由起始密码子所决定,在某些起始密码子上游邻接序列也可能十分重要,被称为Kozak序列(ACCAUGG),它相当于原核的S-D序列。前起始复合物结合5′7meG帽结构并沿着mRNA扫描,借助Kozak序列搜寻第一个起始密码子。)

所谓Kozak规则,即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个ATG中的碱基A,T,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下:
(1)  第4位的偏好碱基为G;
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基;
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基。
Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可。

KOZAK写的那篇关于KOZAK序列的文献:
文献名字:Compilation and analysis of sequences upstream from the translational start site in eukaryotic mRNAs
作者:Marilyn Kozak
下载:PubMed免费下载
据说KOZAK是个个性古怪的女科学家,她发表的文章,署名作者只有她一个。
很个性啊
不过今天我找了很久,关于KOZAK的资料很少
   我查阅了好几本分子生物学的教科书,发现只有人卫版冯作化主编的7年制教材上提及了该序列GCCACCAUGG,并指出在AUG上游第三个嘌呤A碱基和紧跟着AUG后的G是最为重要的,但是该书并未指出该序列是kozak发现的或者是叫做kozak序列,但是目前很多研究真核细胞表达调控的实验室已经广泛将其应用到试验中,并发现了高的表达效率,成数倍或数十倍增长。
   与之相比,SD序列可能要有名的多,复习一下,SD序列是由Shine-Delgemo发现的,由此得名,是指原核生物mRNA 5'-端在起始密码AUG的上游-3~ -11bp处含A-G的短序列(3~9bp),容易与16S RNA的3' 端含T-C序列互补配对,对mRNA与核糖体有效结合和翻译至关重要。
再来总结一下吧
Kozak sequence
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。关于kozak序列的这篇文章发表在Nucleic Acids Res. 1984上,该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。

SD sequence;
原核基因转录和翻译几乎在胞质中同时发生,在mRNA 5’端起始密码子AUG上游-3~-11处,为核蛋白体rRNA的结合位点(3-9bp)因由Shine-Delgarno发现,又称SD序列。此序列富含A-G,恰与16S RNA 3’端富含T-C的序列互补,因此mRNA与核蛋白体sRNA容易配对结合。因此SD序列对mRNA的翻译起重要作用。
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标题 作者 最后发表
中国协和医科大学2005年分子生物学考博试题 chlang 2008-07-26
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